La organización del CIEM Villarrica está conformado por un Directorio constituido por cinco miembros activos, los cuales duran tres años en sus funciones, pudiendo ser reelegidos en asamblea general de socios, el cual se celebra una vez al año. Según el artículo décimo duodécimo de sus estatus al Directorio le corresponde la administración y dirección superior de la Corporación en conformidad a los Estatutos y acuerdo de las asambleas.
Para la implementación de programas y proyectos el Directorio delega funciones de administrar con las mismas facultades que el Representante Legal a una Dirección ejecutiva que tiene como función fijar los lineamientos institucionales, velar por el correcto uso de los recursos humanos, financieros y materiales.
| Nombre | Cargo |
|---|---|
| Ingrid Eliana Prambs Klocker | Presidente del Directorio y Representante legal |
| Priscilla Waleska Toledo Albornoz | Secretario |
| María Angélica Espinoza Gatica | Tesorero |
| Mauricio Alejandro Gaete Parraguez | Director 1 |
| Marixa Angelica Ortega Retamal | Director 2 |

